水生态系统的健康稳定依赖于适宜的pH环境。熟石灰在调节过度酸化或碱化水体的pH值方面，展现出独特的应用价值，其作用远不止于简单的酸碱调节，更在于为水生生物群落的重建与恢复创造了先决条件。
在酸性水体（如受酸雨影响的湖泊）中，低pH环境会直接毒害鱼类（尤其是鱼卵和幼鱼），并溶解底泥中的铝离子，加剧生物毒性。同时，酸性条件会抑制水体中硝化细菌等关键微生物的活性，破坏氮循环，导致生态系统功能紊乱。适时、适量地投加熟石灰，可将水体pH提升至鱼类和大多数水生无脊椎动物适宜的中性范围（pH 6.5-8.5）。这不仅消除了直接的酸毒性和铝毒性，更重要的是，它重新激活了水体自身的微生物代谢功能，促进了营养物质的循环，为浮游植物和高等水生植物的生长提供了基础，进而逐步恢复从生产者到消费者的完整食物链。
反之，在某些因地质条件或工业排放导致的极端碱性水体中，熟石灰并非适用。但在特定情况下，如水体因二氧化碳过量而呈现暂时性酸性波动时，熟石灰的缓冲能力可以稳定pH，避免其对水生生物造成应激。
这种通过化学手段（熟石灰调pH）为生物手段（生态恢复）铺平道路的模式，体现了环境工程与生态学的紧密结合。精准的熟石灰投加，如同为“生病”的水体生态系统开出了一剂“调理药方”，旨在恢复其自身的“免疫力”和“生命力”，最终实现从水质改善到生态重建的协同效应。
