生态农业追求在可持续的前提下生产食物，强调减少外部化学品投入，增强系统内部的生物循环。在这一范式下，“石灰石”粉作为一种天然的土壤改良剂和矿物肥料，其作用远不止于矫正土壤酸度，更延伸到调控土壤微生物群落、促进养分循环乃至贡献于农田碳封存等多重生态功能。
最广为人知的功能当然是中和土壤酸性。过酸的土壤会毒害植物根系，并锁住磷、钾、钙、镁等必需营养元素。石灰石的施入通过提升pH，解放了这些养分，为作物生长创造了健康的化学基础。但它的作用不止于此。作为矿物肥料，石灰石本身就是一种缓释的钙源和镁源（若为白云质石灰石）。钙是细胞壁的重要组成部分，对维持植物组织结构、增强抗病性至关重要。
超越基础营养，石灰石对土壤微生物群落有着深远而积极的影响。大多数土壤有益微生物，包括分解有机质的细菌和与植物共生的菌根真菌，更偏好中性微碱性的环境。石灰石通过改善土壤化学性质，为这些“土壤工程师”创造了理想的栖息地。一个活跃和多样化的微生物群落能更高效地分解有机质，释放养分，形成稳定的团粒结构，并抑制土传病原菌的生长。这种生物网络的激活，是生态农业减少化肥农药依赖的核心机制之一。
此外，石灰石在农田碳封存中扮演着间接而重要的角色。健康的、由石灰石改良的土壤，因其物理结构更好、生物活性更高，能够固定和储存更多的有机碳。一方面，良好的团粒结构保护有机质不被快速分解；另一方面，蓬勃的植物生长（得益于改良后的土壤）通过光合作用固定更多碳，并以根系分泌物和残体的形式将其输入土壤。更引人入胜的是，石灰石本身的风化过程就是一个自然的碳汇过程。碳酸钙与水和大气中的CO₂反应，最终生成可溶的碳酸氢钙，随水迁移并最终在海洋中形成碳酸盐沉积，从而从大气中移除了CO₂。
因此，在生态农业的视野里，石灰石不再被简单地视为一种“土壤矫正药”，而是被视为一个关键的“生态系统启动器”。它通过同步改善土壤的物理、化学和生物属性，启动一个正向的生态循环： healthier soil → healthier plants → richer microbial life → even healthier soil。这种整体性的功能，使其成为构建高产、高效、高韧性的可持续农业生态系统中一块不可或缺的基石。
