面对蓝藻水华，养殖者的第一反应常常是“调水”，而生石灰作为最顺手的调水剂，很容易被顺手泼下去。然而，多个技术来源的一致判断是：蓝藻暴发的水体不宜施用生石灰。理由不是石灰杀不死蓝藻，而是石灰的化学效应恰好落在蓝藻的生态优势区间内。
暴发蓝藻的水体本身pH已经偏高。生石灰进一步抬升pH，等于把水体推向更有利于蓝藻竞争的环境——蓝藻对高pH的耐受性强于许多绿藻和硅藻，碱性条件的强化反而巩固了它的优势地位。与此同时，石灰带来的钙离子与有效磷结合形成沉淀，使水体有效磷浓度进一步下降。蓝藻在低磷条件下的竞争力同样突出，固氮蓝藻甚至可以通过固定空气中的氮气来缓解氮限制。石灰造成的“高pH、低磷”组合，恰恰是蓝藻最擅长的战场。有技术资料将这一后果表述得更为直接：生石灰使用后会造成水体缺磷，影响乃至限制水生植物的生长，可能会造成养鱼低产。
这条禁忌的实践含义不是“蓝藻时什么都不能做”，而是“不能用一种强化蓝藻竞争优势的工具去解决蓝藻问题”。蓝藻暴发时的正确干预方向应当是打破其优势地位——通过换水稀释、机械捕捞、投加针对性抑制剂或引入竞争性藻种——而非向已经倾斜的化学天平上再添一枚有利于蓝藻的砝码。
